Ve 12:18 odpoledne exploduje teroristická bomba v parkovací garáži Světového obchodního centra v New Yorku, takže opouští kráter o šířce 60 stop a způsobuje kolaps několika betonových podlah z oceli. Ačkoli teroristická bomba nedokázala kriticky poškodit hlavní strukturu mrakodrapů, šest lidí bylo zabito a více než 1 000 bylo zraněno. Samotné Světové obchodní středisko utrpělo více než 500 milionů dolarů škody. Po útoku úřady evakuovaly 50 000 lidí z budov, z nichž stovky trpěly inhalací kouře. Evakuace trvala celé odpoledne.
Městské úřady a Federální úřad pro vyšetřování (FBI) podnikly masivní pátrání po podezřelých a během několika dní bylo zatčeno několik radikálních islámských fundamentalistů. V březnu 1994 byli federální porotou odsouzeni Mohammed Salameh, Ahmad Ajaj, Nidal Ayyad a Mahmoud Abouhalima za jejich roli v bombovém útoku a každý z nich byl odsouzen na doživotí. Salameh, Palestinec, byl zatčen, když šel získat zálohu 400 dolarů, kterou nechal pro půjčovnu dodávku Ryder použitou při útoku. Ajaj a Ayyad, kteří oba hráli roli při stavbě bomby, byli brzy poté zatčeni. Abouhalima, který pomáhal kupovat a míchat výbušniny, uprchl do Saúdské Arábie, ale byl chycen v Egyptě o dva týdny později.
Vrchol útoku Ramzi Ahmed Yousef zůstal na svobodě až do února 1995, kdy byl v Pákistánu zatčen. Dříve byl na Filipínách a v počítači, který opustil, byly nalezeny teroristické plány, které zahrnovaly spiknutí zabití papeže Jana Pavla II. A plán bombardování 15 amerických letadel za 48 hodin. Při letu zpět do Spojených států Yousef údajně přiznal agentovi tajné služby, že od začátku řídil útok Trade Center a dokonce tvrdil, že dal pojistku, která vybuchla bombu o hmotnosti 1 200 liber. Podle agenta citoval Jousef pouze jeho lítost, že 110-patrová věž se nespadla do svého dvojče, jak plánovaná katastrofa způsobila tisíce úmrtí.
Eyad Ismoil, který odvezl Ryderův vůz do parkovací garáže pod Světovým obchodním střediskem, byl toho roku v Jordánsku zajat a odvezen zpět do New Yorku. Všichni zúčastnění muži měli vazby na šejka Omar Abdel Rahmana, radikálního egyptského náboženského vůdce, který operoval mimo Jersey City v New Jersey, který se nachází hned za řekou Hudson z Manhattanu. V roce 1995 byli Rahman a 10 následovníků usvědčeni ze spiknutí, aby vyhodili do povětří sídlo OSN a další newyorské památky. Prokurátoři argumentovali, že útok Světového obchodního centra byl součástí tohoto spiknutí, ačkoli byl předložen jen malý jasný důkaz tohoto obvinění.
V listopadu 1997 byli Yousef a Ismoil odsouzeni v soudní síni jen pár bloků od dvojčat a následně odsouzeni k doživotnímu vězení bez možnosti podmíněného propuštění. Pouze jeden další muž, který se domníval, že se na útoku přímo podílí, zůstává irácký Abdul Rahman Yasin.
Po bombových atentátech na americké velvyslanectví v Keni a Tanzanii v roce 1998 začali američtí vyšetřovatelé podezřívat, že Yousef měl vazby na saudskoarabského exilu Usámu bin Ládina, vedoucího anti-U.S. teroristická síť al-Káidy. Zda se bin Ládin ve skutečnosti účastnil útoků na Twin Tower v roce 1993, nebylo určeno, ale 11. září 2019 dokončily dvě skupiny teroristů al-Káidy práci, kterou zahájil Yousef, a na sever a jih věže narazili dvě unesená letadla Světové obchodní centrum.
Strukturální ocel mrakodrapů nedokázala odolat ohromnému teplu generovanému hořícím proudovým palivem a oba se zhroutili do dvou hodin po zásahu. Ve Světovém obchodním centru a jeho okolí zemřelo téměř 3 000 lidí, včetně ohromujících 343 hasičů a 23 policistů, kteří se snažili dokončit evakuaci a zachránit administrativní pracovníky uvězněné ve vyšších patrech. V době svého kolapsu přežilo jen šest lidí ve věži Světového obchodního centra. Téměř 10 000 dalších lidí bylo léčeno pro zranění, mnoho vážných.