Konfederační generál Thomas „Stonewall“ Jackson zajímá Harpers Ferry ve Virginii (dnešní Západní Virginie) a asi 12 000 vojáků Unie, když se armáda generála Roberta E. Leeho přesune na sever do Marylandu.
Federální posádka uvnitř Harpers Ferry byla zranitelná útokem Konfederace po Leeově invazi do Marylandu v září. Strategické město na řece Potomac bylo odříznuto od zbytku armády Unie. Generál George B. McClellan, velitel armády Potomacu, poslal generála Unie Dixona Milese, velitele posádky trajektu Harpers Ferry, aby město za každou cenu držel. McClellan slíbil pomoc, ale musel se vypořádat se zbytkem Konfederační armády.
Jackson stočil své dělostřelectvo na místo a začal město 14. září střílet. Yankeesovi chybělo munice a Miles nabídl malý odpor, než souhlasil s kapitulací ráno 15. září. Jako Milesova pomoc generál Julius White jezdil na Jackson, aby vyjednal podmínky kapitulace, jeden dělo Konfederace pokračovalo v palbě. Miles byl smrtelně zraněn při posledním výstřelu vystřeleném na Harpers Ferry.
Yankeeové odevzdali 73 dělostřeleckých děl, 13 000 pušek a asi 12 000 mužů v Harpers Ferry. Jednalo se o největší kapitulaci Unie z války.
Pád Harpers Ferry přesvědčil Lee, aby změnil své plány. Poté, co 14. září utrpěl těžké ztráty v Marylandu v bitvě na South Mountain, na severovýchod od Harpers Ferry, měl Lee v úmyslu shromáždit své rozptýlené jednotky a vrátit se do Virginie. Nyní, když byl Harpers Ferry v bezpečí, přivolal Jacksona, aby se připojil ke zbytku své síly kolem Sharpsburgu v Marylandu. O dva dny později, 17. září, Lee a McClellan bojovali v bitvě o Antietam.
